ПЦР тест на коронавирус с выявлением британского, южноафриканского/бразильского штаммов коронавируса SARS-CoV-2

Штамм B.1.1.7 или «британский штамм» впервые выявлен в Великобритании в конце 2020 года, хотя происхождение этого штамма все еще точно неизвестно. Данная разновидность вируса отличается от исходного вируса на 23 мутации, из которых 17 могут приводить к серьезным изменениям в свойствах вируса.

Характерные черты британского штамма:

1. На 50-74% повышена способность вируса к передаче между людьми.
2. Недавние исследования показывают, что британский вариант коронавируса связан с более высокой вероятностью госпитализации и смерти, чем исходный штамм.
3. Минимальный ответ на нейтрализующее действие сыворотки выздоравливающих и вакцинированных пациентов.
4. Может не определяться некоторыми ПЦР-тестами, которые направлены на S-ген.

Исследование показало, что британский штамм привел к 227 смертельным случаям среди 54 906 пациентов по сравнению с 141 смертью в группе того же размера, что и другие штаммы коронавируса. Это означает, что британский штамм может быть на 64 процента более смертоносным.

Штамм SARS-CoV-2 B.1.351 выявлен в Южно-Африканской Республике, но активно распространяется по всему миру. 28 декабря 2020 года он найден в Европе. В этом штамме зафиксировано 21 мутация, включая 9 аминокислотных замен в чрезвычайно важном S-белке, которые непосредственно участвуют в проникновении вируса в клетки организма человека. От обычных вариантов вируса отличается быстротой передачи между людьми, и меньшей восприимчивостью к действию защитных антител.

Характерные особенности южноафриканского штамма:

1. В среднем на 50% повышена трансмиссивность (способность вируса к передаче между людьми).
2. Снижена эффективность нейтрализации вируса моноклональными антителами.
3. Понижена эффективность ответа на нейтрализующее действие сыворотки выздоравливающих и вакцинированных пациентов

В Бразилии появился вариант SARS-CoV-2 (известный как P.1). Был выявлен у четырех путешественников из Бразилии, которые были протестированы во время планового обследования в аэропорту Ханэда за пределами Токио, Япония. Этот вариант имеет 17 уникальных мутаций, в том числе три в рецепторсвязывающем домене белка шипа. В настоящее время активно диагностируется во многих странах мира, и с 12 января 2021 года уже найден в Европе.

Характерные черты бразильского штамма:

1. Понижена эффективность нейтрализации вируса моноклональными антителами.
2. Снижена эффективность ответа на нейтрализующее действие сыворотки.
3. Штамм P.1 не считается более смертоносным, но он распространяется легче, чем исходный штамм Covid-19.

Новые тест-системы, которые закуплены ООО «Клиника ЛМС», предназначены для качественного выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2 генетических линий особого эпидемиологического значения (VOC): британский и бразильский/южноафриканский (без дифференцировки) путем обнаружения мутаций в S-гене коронавируса.

Анализ на генотипирование линий коронавируса позволит пациенту:

• узнать, каким штаммом он заражен;
• отслеживать в дальнейшем свой вариант патологии более прицельно и детально;
• при желании, сдать плазму для лечения людей с ослабленным иммунитетом и тяжелым течением уже зная, что им наработаны антитела к конкретному штамму коронавируса.

Не менее важно это и для своевременного проведения противоэпидемических мероприятий в очаге инфекций (изоляция на карантин более широкого круга контактных лиц, в связи с более высокой скоростью передачи этих штаммов SARS-CoV-2), а также в подборе правильной тактики лечения новой коронавирусной инфекции.

Варианты Лабораторного заключения по данной услуге будут следующими:

1. РНК коронавируса не обнаружена.
2. РНК коронавируса обнаружена. Штаммы британский, бразильский/южноафриканский не выявлены.
3. РНК коронавируса обнаружена. Выявлен британский (бразильский/южноафриканский) штамм.

Анализ проводится методом ПЦР. Материал для исследования — мазок из рото- и носоглотки.

За несколько часов до сдачи анализа не рекомендуется есть, чистить зубы, полоскать рот антибактериальными и другими стоматологическими растворами, курить, употреблять леденцы, жевать жевательную резинку.